Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms