Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMTNP53814 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMTNP53814 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMTNP53814 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMTNP53814 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms