Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HK3P52790 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms