Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms