Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms