Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms