Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms