Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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