Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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