Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms