Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms