Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NELFEP18615 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NELFEP18615 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms