Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHGAP10645 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHGAP10645 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHGAP10645 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHGAP10645 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHGAP10645 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHGAP10645 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHGAP10645 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHGAP10645 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHGAP10645 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms