Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms