Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4BP0C0L5 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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