Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms