Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms