Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms