Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms