Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms