Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3QRK9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3QRK9 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms