Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms