Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms