Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms