Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF215Q9Y6U7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF215Q9Y6U7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF215Q9Y6U7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms