Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPQQ9Y646 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPQQ9Y646 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPQQ9Y646 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms