Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms