Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms