Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB2Q9Y5E7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms