Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP3Q9Y446 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP3Q9Y446 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP3Q9Y446 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms