Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIT1Q9Y3P8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms