Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YBX2Q9Y2T7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX2Q9Y2T7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX2Q9Y2T7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms