Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ICE1Q9Y2F5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ICE1Q9Y2F5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ICE1Q9Y2F5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ICE1Q9Y2F5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms