Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF5Q9Y2D1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATF5Q9Y2D1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms