Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNND2Q9UQB3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNND2Q9UQB3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms