Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHOC2Q9UQ13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms