Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAPRE3Q9UPY8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAPRE3Q9UPY8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms