Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP22Q9UPT9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP22Q9UPT9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms