Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP1Q9UPQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms