Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQSEC3Q9UPP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQSEC3Q9UPP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQSEC3Q9UPP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQSEC3Q9UPP2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
IQSEC3Q9UPP2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IQSEC3Q9UPP2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms