Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TFR2Q9UP52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TFR2Q9UP52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFR2Q9UP52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFR2Q9UP52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFR2Q9UP52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFR2Q9UP52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFR2Q9UP52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms