Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FZD1Q9UP38 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD1Q9UP38 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FZD1Q9UP38 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms