Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRQQ9UMZ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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