Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
INO80Q9ULG1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
INO80Q9ULG1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms