Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
ZNF608Q9ULD9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ZNF608Q9ULD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms