Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN2Q9UL51 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCN2Q9UL51 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms