Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAV3Q9UKW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAV3Q9UKW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAV3Q9UKW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms