Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms