Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHPKQ9UHJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHPKQ9UHJ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHPKQ9UHJ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHPKQ9UHJ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHPKQ9UHJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHPKQ9UHJ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHPKQ9UHJ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHPKQ9UHJ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHPKQ9UHJ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHPKQ9UHJ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHPKQ9UHJ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHPKQ9UHJ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHPKQ9UHJ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHPKQ9UHJ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.8 ms