Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM10Q9UDY6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM10Q9UDY6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms